Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DUSP4Q13115 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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