Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK3Q13003 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK3Q13003 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK3Q13003 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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