Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STX4Q12846 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
STX4Q12846 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STX4Q12846 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
STX4Q12846 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STX4Q12846 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STX4Q12846 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STX4Q12846 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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STX4Q12846 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STX4Q12846 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STX4Q12846 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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STX4Q12846 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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STX4Q12846 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
STX4Q12846 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
STX4Q12846 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STX4Q12846 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STX4Q12846 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STX4Q12846 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STX4Q12846 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
STX4Q12846 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STX4Q12846 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STX4Q12846 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STX4Q12846 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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STX4Q12846 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STX4Q12846 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STX4Q12846 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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STX4Q12846 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STX4Q12846 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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STX4Q12846 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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STX4Q12846 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STX4Q12846 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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STX4Q12846 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STX4Q12846 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
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STX4Q12846 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
STX4Q12846 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
STX4Q12846 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
STX4Q12846 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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STX4Q12846 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
STX4Q12846 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
STX4Q12846 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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