Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RAB40BQ12829 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB40BQ12829 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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