Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms