Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NIPAL4Q0D2K0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPAL4Q0D2K0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms