Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD47Q08722 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD47Q08722 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD47Q08722 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD47Q08722 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CD47Q08722 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CD47Q08722 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CD47Q08722 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms