Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDR1Q08345 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDR1Q08345 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms