Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXOSC9Q06265 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXOSC9Q06265 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms