Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPN11Q06124 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPN11Q06124 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms