Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A2Q05940 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms