Protein–RNA interactions for Protein: Q04756

HGFAC, Hepatocyte growth factor activator, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGFACQ04756 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HGFACQ04756 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms