Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms