Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPCQ03188 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms