Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSG1Q02413 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DSG1Q02413 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms