Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAP1Q01518 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms