Protein–RNA interactions for Protein: Q01415

GALK2, N-acetylgalactosamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK2Q01415 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GALK2Q01415 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms