Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A2Q01362 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A2Q01362 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms