Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLTCQ00610 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms