Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FANCCQ00597 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FANCCQ00597 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms