Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX1P83916 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX1P83916 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX1P83916 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX1P83916 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX1P83916 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX1P83916 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX1P83916 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CBX1P83916 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX1P83916 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX1P83916 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX1P83916 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX1P83916 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX1P83916 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX1P83916 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX1P83916 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX1P83916 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX1P83916 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX1P83916 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX1P83916 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX1P83916 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX1P83916 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX1P83916 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX1P83916 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CBX1P83916 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CBX1P83916 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CBX1P83916 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX1P83916 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX1P83916 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX1P83916 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX1P83916 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX1P83916 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX1P83916 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX1P83916 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX1P83916 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CBX1P83916 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBX1P83916 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBX1P83916 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBX1P83916 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBX1P83916 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBX1P83916 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBX1P83916 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBX1P83916 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBX1P83916 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBX1P83916 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBX1P83916 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CBX1P83916 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX1P83916 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX1P83916 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX1P83916 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX1P83916 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX1P83916 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX1P83916 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX1P83916 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX1P83916 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX1P83916 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX1P83916 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CBX1P83916 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms