Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOBP62745 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOBP62745 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOBP62745 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms