Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBE2HP62256 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2HP62256 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms