Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LMO4P61968 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO4P61968 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO4P61968 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO4P61968 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO4P61968 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms