Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RND3P61587 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RND3P61587 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RND3P61587 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RND3P61587 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms