Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM258P61165 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms