Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SH3BGRP55822 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms