Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRPF1P55201 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms