Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23BP54727 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23BP54727 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms