Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDR1P51861 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDR1P51861 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDR1P51861 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR1P51861 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms