Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRE11P49959 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRE11P49959 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRE11P49959 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRE11P49959 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRE11P49959 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms