Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VEGFBP49765 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VEGFBP49765 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms