Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK2P49760 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK2P49760 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK2P49760 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK2P49760 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK2P49760 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK2P49760 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK2P49760 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK2P49760 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK2P49760 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK2P49760 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK2P49760 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK2P49760 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK2P49760 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK2P49760 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK2P49760 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK2P49760 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK2P49760 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK2P49760 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK2P49760 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK2P49760 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK2P49760 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK2P49760 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK2P49760 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK2P49760 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK2P49760 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK2P49760 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK2P49760 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK2P49760 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK2P49760 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK2P49760 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLK2P49760 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLK2P49760 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLK2P49760 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms