Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLK1P49759 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLK1P49759 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLK1P49759 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLK1P49759 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CLK1P49759 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLK1P49759 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms