Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCLCP48506 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCLCP48506 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCLCP48506 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCLCP48506 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCLCP48506 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCLCP48506 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLCP48506 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms