Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP5P45974 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP5P45974 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP5P45974 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP5P45974 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP5P45974 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP5P45974 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP5P45974 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP5P45974 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP5P45974 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP5P45974 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP5P45974 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP5P45974 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP5P45974 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP5P45974 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP5P45974 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP5P45974 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP5P45974 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP5P45974 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP5P45974 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP5P45974 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP5P45974 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP5P45974 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP5P45974 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP5P45974 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP5P45974 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP5P45974 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP5P45974 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP5P45974 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP5P45974 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP5P45974 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP5P45974 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP5P45974 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP5P45974 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP5P45974 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP5P45974 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP5P45974 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP5P45974 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP5P45974 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP5P45974 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP5P45974 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP5P45974 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP5P45974 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP5P45974 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP5P45974 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP5P45974 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP5P45974 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP5P45974 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP5P45974 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP5P45974 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP5P45974 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP5P45974 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP5P45974 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP5P45974 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP5P45974 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP5P45974 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP5P45974 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP5P45974 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP5P45974 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms