Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTTP42858 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTTP42858 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTTP42858 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTTP42858 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTTP42858 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTTP42858 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTTP42858 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTTP42858 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTTP42858 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTTP42858 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTTP42858 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HTTP42858 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTTP42858 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTTP42858 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTTP42858 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTTP42858 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTTP42858 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTTP42858 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTTP42858 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTTP42858 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTTP42858 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTTP42858 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTTP42858 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTTP42858 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTTP42858 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTTP42858 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTTP42858 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTTP42858 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTTP42858 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HTTP42858 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTTP42858 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTTP42858 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTTP42858 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTTP42858 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTTP42858 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTTP42858 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms