Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN4AP35499 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN4AP35499 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms