Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTNNB1P35222 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms