Protein–RNA interactions for Protein: P33076

CIITA, MHC class II transactivator, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIITAP33076 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIITAP33076 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIITAP33076 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIITAP33076 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIITAP33076 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIITAP33076 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIITAP33076 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIITAP33076 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIITAP33076 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIITAP33076 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIITAP33076 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIITAP33076 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIITAP33076 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CIITAP33076 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CIITAP33076 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CIITAP33076 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CIITAP33076 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CIITAP33076 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIITAP33076 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIITAP33076 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms