Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms