Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPIFP30405 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPIFP30405 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PPIFP30405 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPIFP30405 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPIFP30405 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPIFP30405 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PPIFP30405 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPIFP30405 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPIFP30405 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPIFP30405 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PPIFP30405 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PPIFP30405 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms