Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMOD1P29536 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LMOD1P29536 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms