Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DUSP1P28562 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms