Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HTR2AP28223 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms