Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms