Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMLP26374 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMLP26374 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMLP26374 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMLP26374 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMLP26374 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMLP26374 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMLP26374 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMLP26374 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMLP26374 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMLP26374 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMLP26374 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHMLP26374 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMLP26374 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMLP26374 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMLP26374 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMLP26374 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMLP26374 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMLP26374 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMLP26374 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMLP26374 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMLP26374 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMLP26374 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHMLP26374 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHMLP26374 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMLP26374 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMLP26374 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMLP26374 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMLP26374 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMLP26374 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMLP26374 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMLP26374 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMLP26374 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMLP26374 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMLP26374 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHMLP26374 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHMLP26374 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMLP26374 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMLP26374 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHMLP26374 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMLP26374 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMLP26374 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMLP26374 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMLP26374 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMLP26374 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMLP26374 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMLP26374 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMLP26374 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMLP26374 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMLP26374 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMLP26374 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMLP26374 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMLP26374 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMLP26374 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMLP26374 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHMLP26374 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms