Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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