Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B4P23634 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms