Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LMNB1P20700 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms